ดังนั้นแล้วความเสี่ยงของการสูญพันธุ์แซลมอนจากการบริโภคจึงมีสัดส่วนน้อย แต่ใช่ว่าจะไม่มี หน่วยงานที่ดูแลเกี่ยวกับทรัพยากรธรรมชาติในสหรัฐอเมริกา (USGS) มีการเผยแพร่บทความถึงความเสี่ยงสูญพันธุ์ของแซลมอนบางชนิด เช่น ปลาแซลมอนโคโฮในแม่น้ำโคลัมเบีย เป็นต้น แต่ก็ยังยืนยันว่าแซลมอนในมหาสมุทรแปซิฟิค และมหาสมุทรแอตแลนติก ยังไม่เสี่ยงสูญพันธุ์แต่อย่างใด
ประเด็นของการสูญพันธ์ุไม่ได้ถูกพูดถึงเป็นวงกว้าง แต่ปัญหาฟาร์มปลาแซลมอนกลับร้อนแรงกว่า กองทุนสัตว์ป่าโลกสากล (WWF : World Wide Fund for Nature) เผยแพร่บทความเกี่ยวกับอุตสาหกรรมฟาร์มแซลมอนว่า มันส่งผลกระทบต่อทะเลจากการใช้ยาปฏิชีวนะ สารกันบูด และยาฆ่าแมลงในฟาร์ม ยิ่งฟาร์มแซลมอนเยอะมากขึ้นเท่าไร ทะเลยิ่งได้ผลกระทบจากฟาร์มมากขึ้น แต่ถึงอย่างนั้นข้อกล่าวหานี้ยังอยู่ในขั้นทดสอบว่าทะเลได้รับสารเคมีจริงหรือไม่