Taylor มีบทบาทสำคัญในการให้คำแนะนำเกี่ยวกับวิกฤตการณ์เบอร์ลินและปัญหาในอินโดจีน โดยเฉพาะภารกิจสำคัญที่ร่วมกับ Walt Rostow เพื่อเดินทางไปยังอินโดจีนในปี 1961 รายงานจากภารกิจนี้มีผลโดยตรงต่อการตัดสินใจทางทหารของสหรัฐฯ โดยนำไปสู่การเพิ่มความช่วยเหลือทางทหารแก่เวียดนามใต้ และกลายเป็น
นอกจากนี้ บางกิจกรรมของ NSC ถูกมอบหมายให้กับกลุ่มเล็ก ๆ ที่เรียกว่า Standing Group ซึ่งประกอบด้วยผู้แทนที่มีบทบาทสำคัญในรัฐบาล โดยในช่วงแรกกลุ่มนี้ประกอบด้วย ผู้ช่วยรัฐมนตรีประจำกระทรวงการต่างประเทศฝ่ายกิจการการเมือง (Under Secretary of State for Political Affairs) เป็นประธาน
ต่อมาในปี 1963 กลุ่ม Standing Group กลับมาดำเนินการอีกครั้ง โดยมีการเพิ่มสมาชิกใหม่เพื่อขยายขอบเขตและความหลากหลายในที่ประชุม สมาชิกใหม่ที่เพิ่มเข้ามา ได้แก่ อัยการสูงสุด ประธานคณะเสนาธิการร่วม (JCS) ปลัดกระทรวงการคลัง (Under Secretary of the Treasury) ผู้อำนวยการหน่วยงานข้อมูลข่าวสารของสหรัฐฯ (USIA) และผู้บริหารของหน่วยงานเพื่อการพัฒนาระหว่างประเทศ (AID)
กลุ่มนี้มีบทบาทสำคัญในการพิจารณาและจัดการประเด็นสำคัญต่าง ๆ โดยได้จัดประชุมทั้งหมด 14 ครั้ง ในช่วงเวลาที่เหลือของการดำรงตำแหน่งประธานาธิบดีของ John F. Kennedy
หนึ่งในกลุ่มที่สำคัญที่สุดที่ถูกจัดตั้งขึ้นในยุคของประธานาธิบดี John F. Kennedy คือ คณะกรรมการบริหารสภาความมั่นคงแห่งชาติ (The Executive Committee of the National Security Council: ExCom) ซึ่งก่อตั้งขึ้นในฤดูใบไม้ร่วงปี 1962 เพื่อตอบสนองต่อเหตุการณ์ วิกฤตการณ์ขีปนาวุธคิวบา ExCom เป็นกลุ่มเฉพาะกิจที่มีขนาดเล็กกว่าสภาความมั่นคงแห่งชาติทั่วไป โดยมีประธานาธิบดี Kennedy เป็นประธาน กลุ่มนี้ประกอบด้วยบุคคลสำคัญที่ใกล้ชิดและมีบทบาทสำคัญในการจัดการวิกฤต เช่น:
1.
รองประธานาธิบดี
2.
รัฐมนตรีว่าการกระทรวงการต่างประเทศ
3.
รัฐมนตรีว่าการกระทรวงกลาโหม
4.
รัฐมนตรีว่าการกระทรวงการคลัง
5.
อัยการสูงสุด (Robert F. Kennedy ซึ่งเป็นพี่ชายของประธานาธิบดี)