เนื่องจากลำไส้เป็นแหล่งผลิตเซโรโทนินที่สำคัญ การรับประทานอาหารที่มีประโยชน์ต่อจุลินทรีย์ในลำไส้จึงมีความสำคัญ อาหารที่อุดมด้วยโพรไบโอติก เช่น ชาหมัก (Kombucha), กิมจิ, ซาวร์เคราต์ (sauerkraut), ถั่วเหลืองหมัก (Tempeh) รวมถึงผลิตภัณฑ์จากนม เช่น ชีสและโยเกิร์ต ล้วนช่วยส่งเสริมสุขภาพลำไส้