การลดน้ำหนักและความบางของ S Pen บน Galaxy S25 Ultra ทำให้เครื่องนี้มีความสะดวกสบายในการพกพา แต่ Samsung ต้องแลกมาด้วยการตัดหายฟีเจอร์บางอย่าง รวมถึงการตัดชิป Bluetooth ที่เคยรองรับฟีเจอร์พิเศษต่างๆ ไว้ อย่างเช่น Air Actions ซึ่งเป็นฟีเจอร์ที่ช่วยให้สามารถควบคุมหน้าจอจากระยะไกลได้ โดยคิดค้นขึ้นพร้อมกับ Galaxy Note 10 เมื่อห้าปีก่อน
Air Actions เดิมเสนอโอกาสในการควบคุมอินเทอร์เฟซด้วยการวาดท่าทางในอากาศ แต่ตอนนี้ฟีเจอร์นี้กลับถูกละทิ้ง ทำให้ S Pen ไม่สามารถทำหน้าที่เป็นรีโมตหรือควบคุมแอปต่างๆ ได้เหมือนที่เคยเป็น นอกจากนี้ ฟีเจอร์การเลื่อนดูแกลเลอรีและการควบคุมภาพสไลด์การนำเสนอจาก S Pen ก็ไม่สามารถใช้งานได้อีกต่อไป